O Black DigiTron (ブラックデジトロン Burakku Dejitoron) é uma secreção misteriosa que foi descoberta recentemente.[1] Quando misturado com um Digimon, durante o processo de evolução, fá-lo evoluir para uma subespécie negra com capacidades alteradas.
BlackGaogamon torna-se mais resistente, mas perde agilidade[2], enquanto que BlackMachGaogamon prolonga a duração do seu voo, mas atinge uma velocidade máxima menor.[3] BlackGalgomon fica mais forte e tático que Galgomon[4] e BlackRapidmon torna-se quase impossível de vencer em comabte noturno.[4] Omegamon Alter-B fica mais poderoso, mas num estado descontrolado e sem consciência própria.[5]